一、结核分枝杆菌DNA测定
通过体外扩增的方法检测结核分枝杆菌（TB）DNA，适用于TB感染的辅助诊断。
1. 检测内容/临床意义
1.1 结核杆菌感染的快速诊断，结核杆菌因其培养周期长，临床很难采用培养方法进行结核杆菌感染的快速诊断，而采用PCR方法，则可以做到这一点，如通过对痰、血液、淋巴液、脑脊液、胸腔积液、腹水等标本中结核杆菌的PCR检测，可快速诊断肺结核、结核杆菌菌血症、淋巴结合、结核性脑膜炎、结核性胸腹膜炎等。
1.2 抗结核治疗的监测，在抗结核治疗中，采用PCR方法定期检测，可评价抗结核药物的疗效。
1.3 要注意临床“假阳性”问题，PCR检测的是病原体核酸，不管结核杆菌是否为活细菌，PCR均能检出，在经抗生素治疗一个疗程后，建议两周后再做PCR检测，以避免临床假阳性。
2. 样本类型
全血、痰、胸腹水、肺泡灌洗液等呼吸道标本、脑脊液
3. 样本采集
血液：直接抽取外周血2ml(抗凝)。
痰液：用无菌5ml玻璃管取受检者肺深部咳出痰液1-3毫升，密闭，即为标本。
4. 标本保存与运送：标本可立即检测，体液可置于－20℃保存6个月。血液可置于4℃保存24小时。标本运送采用0℃冰壶。
5. 容器及添加剂类型
无菌痰盒
抗凝管：EDTA-2K（乙二胺四乙酸二钾）或者枸橼酸钠均可
无菌管
二、嗜肺军团菌核酸检测
应用荧光定量PCR的方法，定量检测样品中嗜肺军团菌脱氧核糖核酸（LP DNA），适用于嗜肺军团菌感染的辅助诊断和病人药物治疗的疗效监测。监测结果可结合临床表现和其它实验室检测指标对患者病情进行评价。
1. 检测内容/临床意义
嗜肺军团菌可引起军团病，多流行于夏秋季，为全身性疾患，严重者可引起高热、呼吸衰竭、菌血症可引起多脏器感染。同时亦是医院感染的病原菌之一，通常由于中央空调、冷却塔用水污染而导致集体感染。定性检测LP DNA可用于临床对嗜肺军团菌感染的辅助诊断和病人药物治疗的疗效监测。
2. 样本类型
痰液
3. 标本采集：使用一次性吸痰器，患儿取仰头平卧位，将吸痰管缓缓插入咽喉部，调节负压，将气管深部分泌物（在雾化吸入后效果更好）缓缓吸入储液瓶，反复数次，储液瓶中分泌物即为标本，密闭送检。成人可自行留痰：采集前清水漱口2遍，咳深部痰，收集于无菌痰杯中，密闭送检。
4. 标本保存和运送：标本可立即用于测试，也可置于2-8℃，保存期为7天，也可置于-20℃，保存期为6个月。标本运送时应采用0℃冰壶。
5. 容器及添加剂类型
一次性痰杯
三、淋球菌DNA测定
用于生殖泌尿道分泌物中淋球菌（NGH）DNA的检测，作为NGH感染的辅助诊断。
1. 检测内容/临床意义
分泌物
2. 样本类型
淋球菌 DNA检测对淋病的早期诊断、治疗、防止慢性感染有重要价值。与细菌培养 “金标准”相比 ,采用实时荧光PCR方法可很好的解决淋病奈瑟菌感染快速诊断的问题,尤其适用于泌尿生殖道感染的早期诊断及无症状的携带者的检测。
3. 标本采集
3.1 男性生殖泌尿道分泌物棉拭子：用细小棉拭子深入尿道约2-4cm，捻动拭子采集分泌物，将拭子置入无菌玻璃管，密闭送检（采集前2小时禁小便）。
3.2 女性生殖器分泌物棉拭子：用无菌生理盐水棉球洗去宫颈外分泌物，再用无菌棉拭子插入宫颈内，停5秒钟后旋动棉拭子采集宫颈分泌物，将拭子置入无菌玻璃管，密闭送检。
3.3 女性尿道分泌物棉拭子：用无菌生理盐水棉球洗净尿道口，再用无菌棉拭子插入尿道口2cm，捻动拭子采集分泌物，将拭子置入无菌玻璃管，密闭送检（采集前2小时禁小便）。
4. 标本保存与运送：标本可立即检测，标本运送采用0℃冰壶，保存采用-20℃。
5. 容器及添加剂类型
无菌拭子管
四、沙门氏菌及志贺氏菌核酸联合检测
应用荧光定量PCR的方法，定性检测样品中沙门氏菌（Salmonella）及志贺氏菌（Shigella）脱氧核糖核酸（DNA），适用于沙门、志贺氏菌感染的辅助诊断和病人药物治疗的疗效监测。监测结果可结合临床表现和其它实验室检测指标对患者病情进行评价。
1. 检测内容/临床意义
1.1 沙门氏菌感染后通常引发胃肠疾病，5岁以下儿童和年轻人较多见，老年人感染后症状通常较重。常见症状为腹泻、发烧、腹部痉挛、恶心、呕吐和头疼。病原菌进入血液时，感染会加重。志贺氏菌是人类细菌性痢疾最为常见的病原菌，常称为痢疾杆菌。夏秋发病率高，婴儿可呈现消化不良样稀便；3岁以上患儿起病急，以发热、腹泻为主；成人表现为排脓血便、伴全身中毒症状。
1.2 核酸定性检测用于临床对沙门氏菌和志贺氏菌感染的辅助诊断，对患者的临床诊疗应结合其症状/体征、病史、其它实验室检查及治疗反应等情况综合考虑。阴性结果仅说明样本浓度低于试剂检出限值但不能完全排除感染的可能；阳性结果建议采用金标准方法进一步确认。
2. 样本类型
粪便
3. 标本采集：应留取新鲜的粪便标本，取含有粘液、脓血等病变成分的粪便，外观无异常时从表面、深处及粪端多处取材，2-5g为宜；盛放于一次性便盒，不得混有尿液，不得被异物如消毒水、污水等污染。
4. 标本保存和运送：应尽快送检；可在2-8℃放置7天，长期保存置于≤20℃，避免反复冻融。
5. 容器及添加剂类型
一次性便盒
五、B族链球菌DNA测定
适用于检测生殖道和直肠分泌物样品中的B族链球菌DNA，可用于B族链球菌感染的辅助诊断及疗效监控。该项目检测的适用人群为妊娠34-37周的孕妇，在取样前一周内受检者未使用过栓剂和洗液。
1. 检测内容/临床意义
1.1 B族链球菌是目前新生儿感染的主要致病菌之一，孕妇感染后通过产道传播给新生儿，引起新生儿败血症、脑膜炎、肺炎等，死亡率极高。检测生殖道和直肠分泌物样本中的B族链球菌DNA可用于B族链球菌感染的辅助诊断及疗效监控。检测结果仅作为临床参考，不作为B族链球菌感染诊治的唯一依据。
1.2 阴性结果仅说明样本浓度低于试剂检出限值但不能完全排除感染的可能。
2. 样本类型
生殖道分泌物和直肠分泌物
3. 标本采集：适用人群为妊娠34-37周孕妇，在取样前一周内受检者未使用任何抗生素，取样部位未使用过栓剂和洗液。
无菌拭子放置于生殖道低位1/3处，沿生殖道壁轻轻旋转取得分泌物；再小心将该拭子插入肛门，在肛门括约肌以上约2.5cm处，沿肠壁轻轻旋转取得标本，使该拭子上同时取得生殖道分泌物和直肠分泌物。标本置于无菌拭子套管中，密闭送检。
4. 标本保存和运送：尽快送检，室温保存不超过1天，在4-8℃保存不超过6天，长途运输采用冰壶。
5. 容器及添加剂类型
一次性无菌拭子：拭子头采用涤纶、纤维和尼龙等材料，拭子柄为塑料材质。